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 Nouveau record d'extrêmophiles

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ji_louis



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MessageSujet: Nouveau record d'extrêmophiles   Mer 29 Avr 2009 - 10:18

Les limites de la vie sur Terre une nouvelle fois repoussées... dans l'eau !

Une nouvelle espèce d'archaébactérie , Pyrococcus CH1, vivant dans un milieu allant de 85 à 105°C et capable de se diviser jusqu'à une pression hydrostatique de 1200 bars (soit plus de 1000 fois supérieure à la pression atmosphérique), vient d'être découverte par les microbiologistes du Laboratoire de microbiologie des environnements extrêmes (UMR sous la tutelle du CNRS, de l'Ifremer et de l'Université de Bretagne Occidentale), en partenariat avec l'Institut d'Océanographie de Xiamen (Chine) et le Laboratoire des sciences de la Terre (UMR sous la tutelle du CNRS, de l'ENS Lyon et de l'Université de Lyon).

Cette archaébactérie (1) a été isolée à partir d'échantillons de la campagne Serpentine (2), au cours de laquelle une équipe franco-russe a exploré pendant six semaines la dorsale médio-Atlantique à la découverte de nouvelles sources hydrothermales. L'article scientifique relatant cette découverte est publié dans la revue The ISME Journal.


Cheminée hydrothermale sur le site Ashadze (3)


Les extrêmophiles... un monde toujours plus surprenant

Les recherches menées sur les extrêmophiles, ces espèces qui ont la particularité de vivre dans des conditions extrêmes et mortelles pour la plupart des autres organismes, constituent autant de "mondes à découvrir", tous très prometteurs.

En terme de biodiversité d'abord, ces formes de vie, a priori "inimaginables", montrent que l'inventaire de toutes les espèces vivant sur Terre n'est pas prêt d'être fini. Les micro-organismes extrêmophiles sont également une illustration des capacités étonnantes d'adaptation du vivant, ce qui renforce l'hypothèse de l'existence de formes de vie sur des planètes dont on pensait que les conditions environnementales ne le permettaient pas.

Les particularités de Pyrococcus CH1

Les microorganismes piézophiles, également appelés barophiles (aimant la pression), constituent un des sous-ensembles des extrêmophiles. Découverte sur le site "Ashadze" situé à 4100 mètres de profondeur, la souche CH1 est le premier organisme hyperthermophile et piézophile obligatoire connu.
Cette archaébacterie vit entre 85 et 105°C, avec un optimum à 98°C.
Mais, surtout, elle se divise entre 150 et 1200 bars de pression hydrostatique, 520 bars étant sa pression optimum.

Cette découverte repousse une nouvelle fois les limites physico-chimiques de la vie sur Terre et conforte l'idée de l'existence d'une biosphère hyper-thermophile dans les profondeurs de notre planète.

L'étude de la biomasse souterraine (les micro-organismes découverts dans les sédiments des plaques océaniques au fond de la mer) semble très prometteuse: les sources hydrothermales océaniques profondes offrent en effet aux microorganismes des conditions extrêmes de température, de pression et de composition de fluides.

Quels intérêts pratiques peuvent avoir ces microorganismes ?

Du fait des conditions extrêmes de développement, il s'avère que leurs enzymes sont thermostables et aptes à fonctionner dans des réacteurs sous pression. Il est donc tentant de les utiliser dans des procédés industriels, où certaines étapes requièrent des températures et des pressions élevées, notamment pour l'obtention de produits à forte valeur ajoutée, issus aujourd'hui de la chimie fine.

Les 3 domaines du vivant

Il est admis actuellement que les êtres vivants peuvent être classés en 3 domaines:

1. Les eubactéries constituent le premier domaine du vivant. Ce sont des procaryotes (absence de noyau) qui possèdent des propriétés communes, distinctes des archées, pour leurs membranes et leurs génomes. Certaines bactéries sont pathogènes.

2. Les archaébactéries constituent le second domaine du vivant. Ce sont aussi des procaryotes possédant des membranes cellulaires plus résistantes et des génomes apparentés. Ainsi le mécanisme de réplication de l'ADN des archées est-il plus proche de celui des eucaryotes que de celui des bactéries. Aucune archée n'a pour l'instant manifesté de pathogénicité pour l'Homme.

3. Les eucaryotes constituent un groupe d'organismes unicellulaires ou pluricellulaires définis par leur structure cellulaire plus "évoluée" que celle des procaryotes (les archéobactéries et les eubactéries). Les eucaryotes possèdent en particulier des organites divisant l'espace cellulaire en zone dont la fonction est définie, tel que le noyau. Les plantes, les animaux et l'homme sont tous des eucaryotes.


Notes:

(1) Les archaébacteries constituent un des domaines du vivant (voir paragraphe ci-dessus).

(2) Dirigée par Yves Fouquet, Responsable du programme pluridisciplinaire d'étude des milieux extrêmes dans les grands fonds océaniques (programme GEODE) et du laboratoire de Géochimie et Métallogénie d'Ifremer Brest, la campagne Serpentine a rassemblé géologues, géochimistes, biologistes et microbiologistes durant six semaines sur la dorsale Atlantique.

(3)"Achadze", le site hydrothermal le plus profond actuellement connu dans les océans (4100 mètres), a été exploré et échantillonné pour la première fois grâce au ROV Victor 6000, robot téléopéré depuis le Pourquoi pas ?, le navire océanographique de l'Ifremer, lors de la campagne Serpentine.
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Steph



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MessageSujet: Re: Nouveau record d'extrêmophiles   Mer 29 Avr 2009 - 16:46

Passionnant! Les extrémophiles sont peu étudiés et pourtant tellement intéressants!
Bel article au passage (j'ai pas suivi les liens).

J'ajoute aussi qu'il est très intéressant d'étudier leurs protéines pour comprendre comment elles peuvent réagir dans des conditions aussi extrêmes.

Stéphane
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Michel99



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MessageSujet: Re: Nouveau record d'extrêmophiles   Mer 29 Avr 2009 - 18:04

Tiens... petite question.

Quand ils font un prélèvement a cette profondeur, la pression est effectivement énorme... mais est-ce que le prélèvement est conservé à cette pression ou est-ce qu'il est "décompressé" par la remontée ?
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Steph



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MessageSujet: Re: Nouveau record d'extrêmophiles   Mer 29 Avr 2009 - 20:23

A mon (humble) avis, la pression n'a pas beaucoup d'importance: à l'intérieur de la cellule, la pression doit être constante. Faut juste que les parois et membranes résistent, c'est tout.

Stéphane
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Nieur



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MessageSujet: Re: Nouveau record d'extrêmophiles   Mer 29 Avr 2009 - 22:36

sisi la pression a de l'importance : les réactions chimiques à 1000 bars et 80°C ne vont pas se passer de la même façon à 1 bar et 20°C, c'est très très important en chimie !
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Steph



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MessageSujet: Re: Nouveau record d'extrêmophiles   Mer 29 Avr 2009 - 22:50

Oui sans aucun doute que ces facteurs ont de l'importance. Mais les réactions se passent dans la cellule, pas dehors! Qui te dit que la pression dans la cellule est la même?

Stéphane
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Nieur



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MessageSujet: Re: Nouveau record d'extrêmophiles   Jeu 30 Avr 2009 - 0:28

Steph a écrit:
Qui te dit que la pression dans la cellule est la même?

Euh. Tu sais ce qu'il se passe si tu as 1000 bars de pression de différence entre l'intérieur et l'extérieur ? Ça s'équilibre (par un moyen ou un autre). Et c'est pas l'océan qui va descendre à 1 bar Wink
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Steph



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MessageSujet: Re: Nouveau record d'extrêmophiles   Jeu 30 Avr 2009 - 6:22

Nieur a écrit:
Steph a écrit:
Qui te dit que la pression dans la cellule est la même?

Euh. Tu sais ce qu'il se passe si tu as 1000 bars de pression de différence entre l'intérieur et l'extérieur ? Ça s'équilibre (par un moyen ou un autre). Et c'est pas l'océan qui va descendre à 1 bar Wink


Tu veux dire que dans un bathyscaphe les plongeurs sont soumis à la pression extérieure?

Stéphane
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Michel99



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MessageSujet: Re: Nouveau record d'extrêmophiles   Jeu 30 Avr 2009 - 6:48

Je ne suis pas sur et certain qu'une archaébactérie puisse disposer d'un exo squelette comparable à la coque d'un bathyscaphe.
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Le Vieux



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MessageSujet: Re: Nouveau record d'extrêmophiles   Jeu 30 Avr 2009 - 7:57

Salut

Steph a écrit:
Qui te dit que la pression dans la cellule est la même?


Une tonne de pression par cm² peut être ?

Je ne vois pas comment il pourrait en être autrement, il peut peut être y avoir une différence de pression, mais elle ne peut qu'être très faible.

Le Vieux
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Steph



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MessageSujet: Re: Nouveau record d'extrêmophiles   Jeu 30 Avr 2009 - 16:45

Michel99 a écrit:
Je ne suis pas sur et certain qu'une archaébactérie puisse disposer d'un exo squelette comparable à la coque d'un bathyscaphe.


J'avoue que moi non plus.
N'est-t-il pas plus facile pour une petite boule de résister à de fortes pressions qu'à une grosse boule? Je n'en sais rien, je pose juste la question.

Stéphane
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Anthracite



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MessageSujet: Re: Nouveau record d'extrêmophiles   Jeu 30 Avr 2009 - 17:32

Le Vieux a écrit:
Salut

Steph a écrit:
Qui te dit que la pression dans la cellule est la même?


Une tonne de pression par cm² peut être ?

Je ne vois pas comment il pourrait en être autrement, il peut peut être y avoir une différence de pression, mais elle ne peut qu'être très faible.

Le Vieux

Oui, pour les fosses les plus profondes, ce qui n'est pas si mal si on considère que de l'acier "normal" coefficient de sécurité compris, ne fait pas mieux à la compression ou à l'étirement.
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Nieur



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MessageSujet: Re: Nouveau record d'extrêmophiles   Jeu 30 Avr 2009 - 17:43

Steph a écrit:
Michel99 a écrit:
Je ne suis pas sur et certain qu'une archaébactérie puisse disposer d'un exo squelette comparable à la coque d'un bathyscaphe.


J'avoue que moi non plus.
N'est-t-il pas plus facile pour une petite boule de résister à de fortes pressions qu'à une grosse boule? Je n'en sais rien, je pose juste la question.


Disons qu'un exosquelette n'aide pas une reproduction par mitose, et il est plus simple de s'adapter à cette pression (enfin la vie est probablement née dans ces conditions, donc l'adaptation serait à des pressions plus faibles, en définitive) que chercher à y résister.
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Steph



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MessageSujet: Re: Nouveau record d'extrêmophiles   Jeu 30 Avr 2009 - 18:43

Pourquoi dis-tu que la vie serait née dans ces conditions?

Stéphane
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jibus



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MessageSujet: Re: Nouveau record d'extrêmophiles   Jeu 30 Avr 2009 - 18:49

Steph a écrit:
Pourquoi dis-tu que la vie serait née dans ces conditions?


que la vie soit nee dans ces conditions ou pas, pour pouvoir exister, la vie doit s'adapter et chercher les meilleurs moyens de ne pas depenser de l'energie inutile...

du coup, dans un environnement donne, si il existe des reactions chimiques dans cet environnement, le plus simple est d'utiliser les reactions chimiques qui existent, plutot que de chercher a maintenir des conditions qui existent autre part...

autrement, ces cellules seraient purement et simplement developpees moins profondement

non?

'jib
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